A então Associação Brasileira de História das Religiões (ABHR) foi criada em 25 de junho de 1999, na Universidade Estadual Paulista (UNESP), durante aquele que é considerado o seu 1º Simpósio Nacional, organizado por docentes da linha de pesquisa “Religiões e Visões de Mundo” do Programa de Pós-Graduação em História daquela universidade.
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Na Assembleia Geral de 26 de novembro de 2021, optou-se pela alteração do nome para Associação Brasileira para Pesquisa e História das Religiões, mantendo-se a sigla ABHR, com o intuito de refletir melhor a pluralidade de profissionais envolvidos no trabalho que é desenvolvido pela entidade.